Le MIFPR repose sur une idée novatrice qui consiste, à travers les financements de la BEI, à donner un effet de levier aux ressources budgétaires communautaires disponibles au titre du septième programme-cadre de recherche de l'UE (7e PC).
La Communauté européenne mettra à disposition du MFPR une dotation de 1 milliard d'EUR au maximum au titre du septième programme-cadre de recherche (2007-2013). Parallèlement, la BEI y apportera une enveloppe de 1 milliard d'EUR au maximum sur ses ressources propres. Combinées, ces ressources serviront à soutenir des opérations de financement dont le profil de risque est supérieur à la moyenne du portefeuille de prêts de la BEI. Compte tenu du fait que chaque euro provenant du 7e PC et des ressources de la BEI se traduira, en moyenne, par 5 EUR mis à disposition sous la forme de prêts ou de garanties au titre du MFPR, ce mécanisme portera à 10 milliards d'EUR au maximum la capacité globale de la BEI de financer, dans les domaines de la recherche, du développement et de l'innovation (RDI), des projets plus risqués, mais présentant une solvabilité satisfaisante.
À travers le MFPR, la BEI sera en mesure de proposer de nouveaux outils générateurs de valeur ajoutée :